因骨折住院时公司项目结束了，这合理吗？

不合理。依据《劳动合同法》，员工非因工致残在医疗期内，单位不得开除。人事部此时要求写辞职报告，若你未康复且能胜任其他工作，则可能损害你的合法权益。不及时处理，可能导致你失去工作且无法获得应有补偿。
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不合理。应对方式：1.与公司沟通，明确医疗期权益，要求合理安排；2.收集医疗证明、劳动合同等证据；3.若公司坚持，可向劳动仲裁委申请仲裁，维护自身权益；4.必要时，咨询律师提起诉讼，确保合法权益不受侵害。
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对此情况，你可先与公司协商，要求合理安排工作或医疗期待遇。若协商无果，可向劳动仲裁委员会申请仲裁或咨询律师提起诉讼。选择方式需根据具体情况和证据充足程度决定。